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微生物多样性测序(又称扩增子测序)是利用二/三代测序平台,对16S rDNA/18S rDNA/ITS/功能基因等特定区段PCR产物进行高通量测序,突破传统微生物不可培养的缺点,获得环境样本中的微生物群落结构、进化关系以及微生物与环境相关性等信息。


适用领域

1. 医学领域:常见疾病与人体微生物的关系;

2. 动物领域:肠道、瘤胃(如产甲烷菌类群)与动物健康/营养消化研究等;

3。 农业领域:根际微生物与植物互作、农业耕作/施肥处理与土壤微生物群落等;

4. 环境领域:雾霾处理、污水治理、石油降解、酸性矿水处理及海洋环境等;

5. 特殊极端环境:极端环境条件下的微生物类群研究。


美吉优势

*美吉I-Sanger生物信息云,引领行业的交互时代,实现全面、灵活、专业、安全的数据呈递方式。

*采用定向测序技术,避免了非定向测序造成的数据冗余,能充分利用每条有效序列,且便于后期的菌群分类处理。

*环境微生物群落多样性分析有 Illumina PE250/300 和 PacBio平台两种高通量测序平台可供选择,根据不同的测序要求提供不同的解决方案。

*业务方向多元化,可提供微生物与环境,微生物与农牧业及微生物与健康等多领域服务。

*众多成功案例,强大技术支撑、个性方案设计使美吉生物在微生物群落多样性测序及分析方面处于国内领先地位。

*美吉生物利用各组学技术为客户在微生物领域发表文章300+篇,其中宏组学文章10+篇,累计影响因子1000+。


技术路线



技术参数


微生物多样性云分析流程


多样性分析流程集成业内普遍认可的QIIME、mothur等软件对测序数据进行分析,生成的图表符合专业期刊的要求。微生物多样性3.0版的交互分析主要包括七个分析模块:数据质控,物种注释与评估,物种组成分析,样本比较分析,物种差异分析,关联与模型预测分析,进化分析等。上述分析全面的覆盖微生物多样性生信分析内容,美吉生物云会依据用户的诉求对分析内容持续更新和扩展。



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